Module Java Wisemapping

De EjnTricks

Suite à la mise à jour de Ubuntu en 18.04, des erreurs sont enregistrées lors du démarrage de l'application. Celle-ci était disponible, mais certaines fonctions / plugins entraînaient des erreurs.


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Start-icon.png Démarrage Tomcat (18.04)

Dans le cadre de cet article, Wisemapping est déployé sur un serveur Tomcat. Suite à la mise à jour de Ubuntu en 18.04, la version de openjdk est mise à jour. Pour rappel, le service est démarré à l'aide du script /etc/init.d/tomcat8 contenant le code suivant. 

# this is a work-around until there is a suitable runtime replacement
# for dpkg-architecture for arch:all packages
# this function sets the variable JDK_DIRS
find_jdks()
{
    for java_version in 9 8
    do
        for jvmdir in /usr/lib/jvm/java-${java_version}-openjdk-* \
                      /usr/lib/jvm/jdk-${java_version}-oracle-* \
                      /usr/lib/jvm/jre-${java_version}-oracle-* \
                      /usr/lib/jvm/java-${java_version}-oracle
        do
            if [ -d "${jvmdir}" ]
            then
                JDK_DIRS="${JDK_DIRS} ${jvmdir}"
            fi
        done
    done
}

# The first existing directory is used for JAVA_HOME (if JAVA_HOME is not
# defined in $DEFAULT)
JDK_DIRS="/usr/lib/jvm/default-java"
find_jdks

Or sur le répertoire /usr/lib/jvm contient les installations suivantes. 

#ll /usr/lib/jvm
total 108
drwxr-xr-x   6 root root  4096 mai   13 10:49 ./
drwxr-xr-x 110 root root 69632 juin  15 17:14 ../
lrwxrwxrwx   1 root root    25 avril  8 15:16 default-java -> java-1.11.0-openjdk-amd64/
lrwxrwxrwx   1 root root    21 avril 21 15:41 java-1.11.0-openjdk-amd64 -> java-11-openjdk-amd64/
-rw-r--r--   1 root root  2619 avril 21 15:41 .java-1.11.0-openjdk-amd64.jinfo
drwxr-xr-x   7 root root  4096 mai    6 18:25 java-11-openjdk-amd64/
lrwxrwxrwx   1 root root    20 avril 13  2016 java-1.8.0-openjdk-amd64 -> java-8-openjdk-amd64/
-rw-r--r--   1 root root  2600 avril 26 17:59 .java-1.8.0-openjdk-amd64.jinfo
drwxr-xr-x   8 root root  4096 mai   11  2016 java-7-oracle/
-rw-r--r--   1 root root  2543 mai   11  2016 .java-7-oracle.jinfo
drwxr-xr-x   5 root root  4096 avril 24  2016 java-8-openjdk-amd64/
drwxr-xr-x   8 root root  4096 avril 24  2017 java-8-oracle/
-rw-r--r--   1 root root  2643 avril 24  2017 .java-8-oracle.jinfo

Donc d'après le script de démarrage c'est /usr/lib/jvm/default-java, lien sur /usr/lib/jvm/java-1.11.0-openjdk-amd64/, qui est utilisé.

Or avec les versions récentes de Java, la notion de module est introduite et certaines fonctionnalités ne sont plus activées par défaut.

Start-icon.png Démarrage Tomcat (18.10)

Suite à la version 18.10, le serveur Tomcat est démarré à l'aide de systemd. Le fichier de configuration /lib/systemd/system/tomcat8.service déclare la variable ExecStart pour spécifier le script à exécuter. 

#
# Systemd unit file for Apache Tomcat
#

[Unit]
Description=Apache Tomcat 8.5 Web Application Server
Documentation=https://tomcat.apache.org/tomcat-8.5-doc/index.html
After=network.target

[Service]

# Configuration
Environment="CATALINA_HOME=/usr/share/tomcat8"
Environment="CATALINA_BASE=/var/lib/tomcat8"
Environment="CATALINA_TMPDIR=/tmp"
Environment="JAVA_OPTS=-Djava.awt.headless=true"
EnvironmentFile=-/etc/default/tomcat8

# Lifecycle
Type=simple
ExecStartPre=+/usr/libexec/tomcat8/tomcat-update-policy.sh
ExecStart=/bin/sh /usr/libexec/tomcat8/tomcat-start.sh
SuccessExitStatus=143

# Logging
SyslogIdentifier=tomcat8

# Security
User=tomcat8
Group=tomcat8
PrivateTmp=yes
AmbientCapabilities=CAP_NET_BIND_SERVICE
NoNewPrivileges=true

[Install]
WantedBy=multi-user.target

Le contenu du script est le suivant et un le script /usr/libexec/tomcat8/tomcat-locate-java.sh est exécuté au démarrage. 

#!/bin/sh
#
# Startup script for Apache Tomcat with systemd
#

set -e

# Find the Java runtime and set JAVA_HOME
. /usr/libexec/tomcat8/tomcat-locate-java.sh

# Set the JSP compiler if configured in the /etc/default/tomcat8 file
[ -n "$JSP_COMPILER" ] && JAVA_OPTS="$JAVA_OPTS -Dbuild.compiler=\"$JSP_COMPILER\""

export JAVA_OPTS

# Enable the Java security manager?
SECURITY=""
[ "$TOMCAT_SECURITY" = "yes" ] && SECURITY="-security"


# Start Tomcat
cd $CATALINA_BASE && exec $CATALINA_HOME/bin/catalina.sh run $SECURITY

Et c'est dans ce script, /usr/libexec/tomcat8/tomcat-locate-java.sh, que la recherche de la JVM a été déplacé. 

#!/bin/sh
#
# Script looking for a Java runtime suitable for running Tomcat
#
# The script looks for the default JRE/JDK, OpenJDK and Oracle JDK
# as packaged by java-package. The Java runtime found is exported
# in the JAVA_HOME environment variable.
#

set -e

# Find the Java runtime if JAVA_HOME isn't already defined
if [ -z "$JAVA_HOME" ]; then
    # This function sets the variable JDK_DIRS
    find_jdks()
    {
        for java_version in 11 10 9 8
        do
            for jvmdir in /usr/lib/jvm/java-${java_version}-openjdk-* \
                          /usr/lib/jvm/jdk-${java_version}-oracle-* \
                          /usr/lib/jvm/jre-${java_version}-oracle-* \
                          /usr/lib/jvm/java-${java_version}-oracle \
                          /usr/lib/jvm/oracle-java${java_version}-jdk-* \
                          /usr/lib/jvm/oracle-java${java_version}-jre-*
            do
                if [ -d "${jvmdir}" ]
                then
                    JDK_DIRS="${JDK_DIRS} ${jvmdir}"
                fi
            done
        done
    }

    # The first existing directory is used for JAVA_HOME
    JDK_DIRS="/usr/lib/jvm/default-java"
    find_jdks

    # Look for the right JVM to use
    for jdir in $JDK_DIRS; do
        if [ -r "$jdir/bin/java" -a -z "${JAVA_HOME}" ]; then
            JAVA_HOME="$jdir"
        fi
    done
    export JAVA_HOME
fi

if [ -z "$JAVA_HOME" ]; then
    echo "<2>No JDK or JRE found - Please set the JAVA_HOME variable or install the default-jdk package"
    exit 1
fi

Mylogs-icon.png Messages erreur

Lors du démarrage de Tomcat, les messages suivants sont constatés. 

2018-06-22 16:53:03,276 ERROR org.springframework.web.servlet.DispatcherServlet - Context initialization failed
org.springframework.beans.factory.BeanCreationException: Error creating bean with name 'org.springframework.web.servlet.mvc.method.annotation.RequestMappingHandlerAdapter#0': Initialization of bean failed; nested exception is java.lang.NoClassDefFoundError: javax/xml/bind/JAXBException
        at org.springframework.beans.factory.support.AbstractAutowireCapableBeanFactory.doCreateBean(AbstractAutowireCapableBeanFactory.java:527)
        at org.springframework.beans.factory.support.AbstractAutowireCapableBeanFactory.createBean(AbstractAutowireCapableBeanFactory.java:456)
        at org.springframework.beans.factory.support.AbstractBeanFactory$1.getObject(AbstractBeanFactory.java:294)
        at org.springframework.beans.factory.support.DefaultSingletonBeanRegistry.getSingleton(DefaultSingletonBeanRegistry.java:225)
        at org.springframework.beans.factory.support.AbstractBeanFactory.doGetBean(AbstractBeanFactory.java:291)
        at org.springframework.beans.factory.support.AbstractBeanFactory.getBean(AbstractBeanFactory.java:193)
        at org.springframework.beans.factory.support.DefaultListableBeanFactory.preInstantiateSingletons(DefaultListableBeanFactory.java:605)
        at org.springframework.context.support.AbstractApplicationContext.finishBeanFactoryInitialization(AbstractApplicationContext.java:925)
        at org.springframework.context.support.AbstractApplicationContext.refresh(AbstractApplicationContext.java:472)
        at org.springframework.web.servlet.FrameworkServlet.configureAndRefreshWebApplicationContext(FrameworkServlet.java:631)
        at org.springframework.web.servlet.FrameworkServlet.createWebApplicationContext(FrameworkServlet.java:588)
        at org.springframework.web.servlet.FrameworkServlet.createWebApplicationContext(FrameworkServlet.java:645)
        at org.springframework.web.servlet.FrameworkServlet.initWebApplicationContext(FrameworkServlet.java:508)
        at org.springframework.web.servlet.FrameworkServlet.initServletBean(FrameworkServlet.java:449)
        at org.springframework.web.servlet.HttpServletBean.init(HttpServletBean.java:133)
        at javax.servlet.GenericServlet.init(GenericServlet.java:158)
        at org.apache.catalina.core.StandardWrapper.initServlet(StandardWrapper.java:1144)
        at org.apache.catalina.core.StandardWrapper.loadServlet(StandardWrapper.java:1091)
        at org.apache.catalina.core.StandardWrapper.load(StandardWrapper.java:983)
        at org.apache.catalina.core.StandardContext.loadOnStartup(StandardContext.java:4962)
        at org.apache.catalina.core.StandardContext.startInternal(StandardContext.java:5274)
        at org.apache.catalina.util.LifecycleBase.start(LifecycleBase.java:150)
        at org.apache.catalina.core.ContainerBase.addChildInternal(ContainerBase.java:754)
        at org.apache.catalina.core.ContainerBase.addChild(ContainerBase.java:730)
        at org.apache.catalina.core.StandardHost.addChild(StandardHost.java:734)
        at org.apache.catalina.startup.HostConfig.deployDirectory(HostConfig.java:1140)
        at org.apache.catalina.startup.HostConfig$DeployDirectory.run(HostConfig.java:1874)
        at java.base/java.util.concurrent.Executors$RunnableAdapter.call(Executors.java:514)
        at java.base/java.util.concurrent.FutureTask.run(FutureTask.java:264)
        at java.base/java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1135)
        at java.base/java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:635)
        at java.base/java.lang.Thread.run(Thread.java:844)
Caused by: java.lang.NoClassDefFoundError: javax/xml/bind/JAXBException
        at java.base/java.lang.Class.getDeclaredConstructors0(Native Method)
        at java.base/java.lang.Class.privateGetDeclaredConstructors(Class.java:3090)
        at java.base/java.lang.Class.getDeclaredConstructors(Class.java:2316)
        at org.springframework.beans.factory.annotation.AutowiredAnnotationBeanPostProcessor.determineCandidateConstructors(AutowiredAnnotationBeanPostProcessor.java:229)
        at org.springframework.beans.factory.support.AbstractAutowireCapableBeanFactory.determineConstructorsFromBeanPostProcessors(AbstractAutowireCapableBeanFactory.java:962)
        at org.springframework.beans.factory.support.AbstractAutowireCapableBeanFactory.createBeanInstance(AbstractAutowireCapableBeanFactory.java:935)
        at org.springframework.beans.factory.support.AbstractAutowireCapableBeanFactory.doCreateBean(AbstractAutowireCapableBeanFactory.java:485)
        at org.springframework.beans.factory.support.AbstractAutowireCapableBeanFactory.createBean(AbstractAutowireCapableBeanFactory.java:456)
        at org.springframework.beans.factory.support.BeanDefinitionValueResolver.resolveInnerBean(BeanDefinitionValueResolver.java:271)
        at org.springframework.beans.factory.support.BeanDefinitionValueResolver.resolveValueIfNecessary(BeanDefinitionValueResolver.java:121)
        at org.springframework.beans.factory.support.BeanDefinitionValueResolver.resolveManagedList(BeanDefinitionValueResolver.java:354)
        at org.springframework.beans.factory.support.BeanDefinitionValueResolver.resolveValueIfNecessary(BeanDefinitionValueResolver.java:154)
        at org.springframework.beans.factory.support.AbstractAutowireCapableBeanFactory.applyPropertyValues(AbstractAutowireCapableBeanFactory.java:1360)
        at org.springframework.beans.factory.support.AbstractAutowireCapableBeanFactory.populateBean(AbstractAutowireCapableBeanFactory.java:1118)
        at org.springframework.beans.factory.support.AbstractAutowireCapableBeanFactory.doCreateBean(AbstractAutowireCapableBeanFactory.java:517)
        ... 31 more
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: javax.xml.bind.JAXBException
        at org.apache.catalina.loader.WebappClassLoaderBase.loadClass(WebappClassLoaderBase.java:1308)
        at org.apache.catalina.loader.WebappClassLoaderBase.loadClass(WebappClassLoaderBase.java:1136)
        ... 46 more

L'accès à la classe javax/xml/bind/JAXBException nécessite l'activation du module java.xml.bind.


Icon-Configuration-Settings.png Ajout module

Afin d'activer le module, il suffit d'ajouter l'argument --add-modules avec la valeur java.xml.bind à l'exécution de Java. Etant sur Tomcat8, ceci s'effectue dans le script /var/lib/tomcat8/bin/setenv.sh comme expliqué dans l'article suivant. 

#!/bin/sh

export CATALINA_OPTS="-Xms256m -Xmx512m"

export MAVEN_OPTS="-Xmx512m"

export JAVA_OPTS="$JAVA_OPTS --add-modules java.xml.bind"
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